Грязь, разводы и непонятные пятна
1220 апреля 2006
12.04.06. Среда. Сделал электрофорез белков из клеточных лизатов, приготовленных вчера. Долго возился с приготовлением полиакриламидного геля. Когда белки были разделены, поставил электроперенос белков из геля на нитроцеллюлозную мембрану на ночь. Потом поехал в общежитие. Мне сделали прививку от кори.
13.04.06. Четверг. Сегодня довел эксперимент до конца. Получил плохой результат, точнее сказать, никакого результата не получилось. Вместо ожидаемой красивой картинки из полос детектируемого белка грязь, разводы и непонятные пятна. Я сильно расстроился. Эксперимент длился три дня, а в итоге ничего не вышло. В голове в который раз появились мысли: а моё ли это дело наукой заниматься?..
14.04.06. Пятница. В лабораторию не пошел. Нет ни настроения, ни желания что-либо делать. Остался в общежитии. Почти весь день спал.
15.04.06. Суббота. После обеда я заехал в лабораторию. Нужно было обсудить данные, полученные одним из студентов, делающим в нашей лаборатории курсовую работу. Его задача состояла в том, чтобы проверить данные, полученные с помощью полуколичественного ПЦР, другим методом. Другим методом, используемым для определения количества мРНК, является нозерн-гибридизация. Это принципиально иной метод. Качественно, результаты повторяли картину, которую я получил своим методом, но отличались количественно. Главное, что качественно результаты двух различных методов согласовывались, а количественные различия на втором плане.
Около 17 часов я уже был в школе. Сегодня снова семинар молекулярных биологов. На этот раз обсуждали механизмы, по которым клетка борется с так называемыми подвижными генетическими элементами. На семинаре вместе с докладчиком присутствовало только три человека. Тем не менее плодотворное обсуждение доклада получилось.
После семинара за чаем я поделился с ребятами тем, что пишу статью. Меня стали расспрашивать, в какой, мол, журнал-то. Я ответил, что в хороший зарубежный, например FEBS или JBC. Ребята почему-то рассмеялись и сказали, что это очень хорошие журналы! В дальнейшей беседе я убедил собеседников в серьезности своих намерений. Их удивило то, что работа по теме статьи ещё не закончена, а я уже начал писать. Но признали, что это логично, так можно лучше понять, в каком направлении исследований нужно двигаться и какие эксперименты нужно сделать для завершённости работы. Я заверил их в том, что уже есть результаты, что в целом определены рамки исследований, намечены пути исследований, которые в итоге могут гарантированно дать результат. Иными словами, часть работы сделана, известно, что нужно делать дальше, поэтому и стало возможным начать писать статью ещё до завершения работы.
Потом в школе я посмотрел фильм Джима Джармуша «Пес-призрак, или Путь самурая». Мне больше понравился фильм «Мертвец» этого же режиссёра. Привлекают вдумчивость его фильмов, некая скрытая мысль или, может, несколько мыслей; в его фильмах есть над чем поразмыслить. При этом режиссёр обходится минимумом средств и спецэффектов для создания своих работ. Они на первый взгляд просты для восприятия, но вместе с тем не так элементарно понять, какие именно мысли хотел донести режиссёр до зрителя.
Кажущаяся простота и сложность сущности это так близко к сути природных явлений
16.04.06. Воскресенье. У себя «дома» на ноутбуке посмотрел фильм «Матрица-2: Перезагрузка». Невольно вспоминается молитва программиста, не один раз процитированная в работах Владимира Шахиджаняна: «Господи, перезагрузи этот мир». И режиссёр делает эту попытку. В этом фильме устами героев говорятся некоторые хорошие мысли. Проблема выбора. Вечное «что делать» и как знать, что делать дальше? Что значит верить и кому верить? Но при этом слишком много пустой болтовни, напыщенности, пафоса, невообразимых трюков. Словом, американский фильм.
17.04.06. Понедельник. С утра состоялись защиты курсовых работ на кафедре молекулярной биологии. Я помню свой день защиты около 4 лет назад. Это волнение, ожидание вопросов. Я помню, с каким трудом мне удалось выполнить свою работу. Мне хотелось сделать её всю своими руками. Мне не доверяли полностью. Но я был упорен и своего добился, хотя и не без конфликтов. Сегодня я смотрел на это с другой стороны. Чувствовал себя более опытным, более знающим, более уверенным. Я же уже аспирант! Чувствовал волнение студентов, которые защищались от нашей лаборатории. Видел их растерянность перед вопросами, которые буквально били по слабым местам их работ. Так и хотелось встать и защитить их. Но нет, так нельзя. Тот, кто встал на путь ученого, должен идти по нему сам и сам преодолевать все его тернии.
В лабораторию сегодня не пошел. А что мне ещё оставалось делать? Прошлую неделю я потратил на эксперимент, который в итоге ничего не получился. Что мне докладывать на семинаре?
Защиты закончились где-то к часу дня. Стояла хорошая солнечная погода. Я не спеша пообедал в столовой Главного здания МГУ. Потом поехал в общагу. В тишине и покое разбирался в статьях. Планировал эксперименты на эту неделю.
18.04.06. Вторник. День выдался пасмурным. У меня было подавленное настроение. Вдобавок состояние было болезненным, появился насморк. Я ничего не сделал из того, что запланировал на этот день. Раньше времени ушел домой.
19.04.06. Среда. Кинетический эксперимент по белку закончился крахом. Белок не удалось детектировать. Сотрудница Вера сказала, что она тоже не смогла детектировать белок в этом штамме дрожжей. Вдруг я вспомнил, как на дипломной работе безуспешно пытался увидеть этот мутантный белок
После недолгих размышлений я вспомнил, что штамм дрожжей, в котором мы детектируем мутантный белок, отличается от всех других штаммов тем, что в его геном введены определенные мутации. За счет этих мутаций в этом штамме можно производить гораздо большее количество белка, чем в каком-либо другом. Это означает, что если в нем искусственно синтезировать белок, то клетка просто не сможет его уничтожить весь и этот белок будет в ней накапливаться.
Если это верно, тогда нет смысла ставить кинетику с мутантным белком. В этом штамме его содержание так же мало, как и содержание полноразмерного белка. И он не работает значит, дело не в его концентрации, а в другом. Пока остается только одно предположение модификация убиквитином.
В 16.00 состоялся межлабораторный семинар. Представлялась докторская диссертация. Доклад был длинным, но довольно интересным. Докладчик сразу сказал, что не хочет говорить сухим академическим языком, и выложил буквально историю в лицах о том, как развивалось его исследование. Каким трудным оно было и к каким успехам оно привело.
20.04.06. Четверг. Выдался хороший, солнечный день. Несмотря на это, моё настроение было рабочим. Сделал два опыта. Один не получился. Это меня немного расстроило. Опыт был, на мой взгляд, элементарным. Результат второго узнаю завтра.
Сидел и играл на компьютере. В принципе играть в лаборатории не рекомендуется, но это хороший способ убить время, пока идет какая-нибудь инкубация или длительный опыт. Конечно, можно было бы это время занять чтением статей. Но по себе заметил, что когда хорошо работают руки, то мозги работают плохо. И наоборот.
Продолжение следует
