Дрожжи с гармошкой
1331 марта 2006
13.03.06. Понедельник. Докладываю результаты своих опытов для двух генов. Пошло бурное обсуждение. В результате возникло предположение о том, что эти данные могут отражать не функциональную активность белка, а его стабильность. Так как в некоторых конструкциях у белка удалялись сигналы деградации, и, возможно, его содержание в клетке менялось. Наиболее четко это было видно для «обрубка» с удаленной передней частью. Это единственный конструкт, который мы детектируем в клетках. Но содержание других конструктов мы не можем определить, а значит, нельзя сравнить между собой, одинаково оно или отличается.
Это больное место моей работы. У меня сразу упало настроение. Я с каким-то неестественным для меня безразличием следил за ходом суждений. В конце концов, один из сотрудников предположил, что из-за накопления белка может происходить его инактивация. Он же предложил поставить кинетический эксперимент, в котором нужно проследить за активностью белка по мере его накопления в клетке.
Вроде бы разумный эксперимент, но он требует больших затрат усилий, реактивов и времени. Я нехотя согласился его делать. Но что-то внутри меня протестовало. Я был сильно измотан.
Назавтра назначена репетиция перед аттестацией.
14.03.06. Вторник. Готовлюсь к репетиции. Аттестация переносится на 20-е число. Это понедельник. Репетиция перенесена на пятницу. Срыв планов съездить домой. Началось бурное обсуждение кинетического эксперимента. Я заявил, что ничего делать не хочу. Я устал. Я хочу домой.
Всю ночь я не спал. Обдумывал, с помощью каких экспериментов можно показать, что мои результаты отражают не стабильность белка, а его функциональную активность. Ничего стоящего не смог придумать заснул под утро.
15.03.06. Среда. Очень не хочется идти в институт. Весь день спал. Просыпался, думал и снова засыпал. Изредка просматривал уже имеющиеся статьи. На исходе дня смог все-таки придумать эксперимент.
16.03.06. Четверг. Голова была немного тяжелой после долгих размышлений. В институт все же пошел. С научным руководителем и старшим научным сотрудником обсудили найденный мною метод. Я полагал, что с его помощью удастся определить количество белка. Но оказалось это далеко не так. Этим методом нельзя ничего количественно измерить. Научный руководитель предложил, что белок надо оставить в покое, мы не можем измерить его содержание. Дальнейший ход экспериментов определить, какой минимальный кусочек из передней части надо оставить, чтобы белок работал. Я с этим согласился.
17.03.06. Генеральная уборка в лабораторной комнате. Перебрали реактивы в стенном шкафу, старые оставили в коридоре, объявив, что кому они нужны могут их взять. Желающих из соседних лабораторий набралось около десятка. Все возбужденно стали делить добычу.
Вечером состоялась репетиция. Я заранее подготовил презентацию. Написал и отрепетировал текст. Регламент выступления 10 минут. Я уложился. Другие наши аспиранты тоже неплохо выступили со своими докладами.
18.03.06. В школе вечером устроил досрочно день рождения. Пригласил самых, самых близких знакомых. Долго играли в «апельсин» на фанты. Сидели до четырёх утра.
19.03.06. Воскресенье, спал очень долго. Купил билеты на поезд до Кирова. Готовил и правил текст к завтрашней аттестации. И все время я не переставал думать о том, что же может быть в этой удаленной части белка. И какие нужно сделать еще конструкции, чтобы найти участок, отвечающий за его работоспособность. Вечером мне пришла в голову мысль, что, возможно, дело не в структуре белка, а в его модификациях. Наиболее вероятной мне показалось присоединение маленького белочка, называемого убиквитином
20.03.06. Понедельник. Аттестация аспирантов. Все прошло хорошо. Моей работой заинтересовались. Задавали вопросы. После аттестации я встретился с Верой, и мы обсудили, какие конструкции мы сделаем дальше. Я поделился с ней мыслью о роли модификации белка убиквитином. Она согласилась, что это нужно учесть при планировании дальнейших экспериментов. Вечером я уже был в поезде и ехал домой прочь от шумной и суетливой Москвы в свой тихий и уютный край.
2127.03.06. Устроил себе каникулы. Встречался с друзьями. Посмотрел новый дом, который купили родители. Он находился ближе к центру села там, где живет большинство наших знакомых и где находятся магазины, банк, столовая и клуб. Новый дом мне понравился он более уютный. Построен семь лет назад. И вправду, совсем ещё новый.
Жизнь в селе идет спокойно и размеренно. Новый день мало чем отличается от предыдущего. Я наслаждался спокойствием и отсыпался. Душа залечивала раны от городских стрессов.
23 марта мы отпраздновали день рождения. Пригласили знакомых и весело, с гармошкой провели время.
28.03.06. Вернулся в Москву. День провел за чтением статей.
29.03.06. Пришел в лабораторию. Сразу же заметил, что у сотрудников уставшие лица. А мне хорошо, ведь я отдохнул. Поинтересовался у Веры, что она сделала, чтобы получить те конструкции, которые мы с ней обсуждали до моего отъезда. Оказалось, что она ничего не сделала. Решила дождаться меня, чтобы более подробно обсудить планы дальнейших экспериментов.
30.03.06. Решил поставить опыт с ростом дрожжей на чашках Петри. Опыт очень простой и наглядный. На чашках рассевается серия разведений клеточной культуры разных штаммов. Если по каким-то причинам один штамм растет хуже другого, то эта разница на чашках выражается в том, что начиная с определенного разведения количество и размер образовавшихся колоний одного из штаммов меньше, по сравнению с другим. Я повторял эксперимент одной из статей, при этом в среду добавлял химический агент, вызывающий у клеток состояние стресса.
31.03.06. На чашках ничего не выросло. Наверное, еще рано. Нависла проблема с формальдегидом. Реактив закончился, а опыты надо ставить. Видимо, кроме меня этим не кому больше заняться. Все увлечены своей работой. Ладно, куплю реактив на следующей неделе.
Продолжение следует